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一株產(chǎn)纖維素酶真菌的篩選及產(chǎn)酶條件優(yōu)化

發(fā)布日期:2015-06-02 11:30:17
木質(zhì)纖維是自然界最豐富的可再生資源,占整個植物細(xì)胞千重的90%以上。不同植物中木質(zhì)纖維素酶各種組分的含量是不同的,軟木中的木質(zhì)素 含量比硬木高,草中的纖維素含量最高。一般來說, 木質(zhì)纖維素中含纖維素45%、半纖維素30%和木 質(zhì)素25%[1]。其中含量最高的纖維素必須通過纖維 素酶的作用分解成還原糖的形式方可用于乙醇發(fā) 酵等領(lǐng)域[2]。然而,就目前國內(nèi)外研究現(xiàn)狀,纖 維素酶活力不高是限制木質(zhì)纖維資源利用的主要 因素[3],所以選育高產(chǎn)纖維素酶的菌種是關(guān)鍵所在。 產(chǎn)纖維素酶的生物種群十分廣泛,如細(xì)菌、真菌、 放線菌及昆蟲、軟體動物和原生動物等,而目前 主要是利用細(xì)菌、真菌和放線菌等微生物發(fā)酵來 獲得纖維素酶[4]。細(xì)菌類包括纖維黏菌屬、纖維 桿菌屬和芽孢桿菌屬等;放線菌包括鏈霉屬、高 溫放線菌屬和彎曲熱單胞菌等;真菌類包括木霉
屬、曲霉屬、青霉屬、漆斑霉屬、孢霉屬等[5]。 本研究從自然界篩選得到一株高產(chǎn)纖維素酶的真 菌,經(jīng)鑒定為鐮刀菌屬,拓寬了產(chǎn)纖維素酶的真 菌屬種,為木質(zhì)纖維的降解提供了參考。
1材料與方法
1.1實驗材料 1.1.1樣品
采集地點為湖北省神農(nóng)架保護(hù)區(qū),具體采樣 地點包括大龍?zhí)丁Ⅷ喿涌?、板壁巖等地,樣品均 為森林腐質(zhì)土壤。稻草粉,收集長沙縣脫谷稻草 秸稈,剪成3 cm片段,烘干后用微型植物粉碎機(jī) 粉碎至30?120目。
1.1.2培養(yǎng)基
① CMC-Na 培養(yǎng)基:CMC-Nal5g,NH4N03 lg,酵母膏 lg,MgSO4_7H2O0.5g,KH2P04lg, 去離子H20 1 000 mL,瓊脂2%, pH自然。②剛 果紅纖維素鑒定培養(yǎng)基:(NH4)2SO40.2%,MgS04 ■7H20 0.05%, K2HP〇4〇.1%, NaCl 0.05%, CMC- Na2.0%g,剛果紅 0.02%,瓊脂 2.0%, pH 自然。 ③濾紙液體培養(yǎng)基:濾紙2 g, NH4N03 1 g,酵母 膏 1 g, MgS04,7H20 0.5 g, KH2P04 1 g,去離子 H20 250 ml。④液體產(chǎn)酶鑒定培養(yǎng)基[<s]:蛋白胨3 g, 酵母膏 0.2g,(NH4)2S042 g,KH2P044 g,CaCl2 •2H20 0.3 g, MgS04-7H20 0.3 g, CMC-Na 10 g, 去離子H20 1 000 mL, pH自然。⑤種子培養(yǎng)基: 葡萄糖20 g/L,蛋白胨1 g/L, Mandels營養(yǎng)鹽濃 縮液100 ml/L, Mandels微量元素濃縮液1 ml/L,
1 mol檸檬酸緩沖液50 ml/L。
1.2分析方法
1.2.1初篩方法
利用CMC-Na培養(yǎng)基獲得純菌落,用1 mg/ mL的剛果紅溶液染色30min[7],再用蒸餾水清 洗,最后用1 mol/L的NaCl溶液脫色30 min。以 透明圈的直徑和菌落直徑的比值大小作為篩選的 標(biāo)準(zhǔn),將篩選到的菌株接種到濾紙液體培養(yǎng)基中, 28°C, 180r/min,以不接種住何菌株的濾紙液體 培養(yǎng)基作為空白對照,重復(fù)3次實驗,以濾紙的 失重率作為篩選的標(biāo)準(zhǔn),XKw-wO/w,其中w 為最初濾紙質(zhì)量,降解后濾紙經(jīng)烘干后的質(zhì)量。 1.2.2復(fù)篩方法
將初篩得到的幾株菌按5%的接種量接種到液 體產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,28°C, 180 r/min,振蕩培養(yǎng)5天后, 將培養(yǎng)液4 000 r/min離心10 min,取其上清液測
定酶活(FPA酶活、CMC酶活)大小。
1.2.3酶活測定[8]
FPA酶活:取四支試管,將裁剪成50±0.5 mg濾紙條折成M形沿豎直方向推到試管底部,加 入0.05 mol pH4.8檸檬酸緩沖液1.5 mL,待測酶液 0.5mL (空白管不加),充分混勻后于50°C水浴 放置60 min,迅速向各管加入DNS試劑3 mL, 空白管加酶液0.5 mL,沸水浴放置10 mim冷卻 后定容至25mL,用空白管調(diào)零,540nm測定0D 值,以吸光度平均值查標(biāo)準(zhǔn)曲線計算還原糖含量。
CMC酶活:取4支試管,分別加入用0.05 mol pH4.8檸檬酸緩沖液配置的CMC-Na液2 mL,待測酶液0.5mL (空白管不加),充分混勻 后于50°C水浴放置30 min,迅速向各管加入DNS 試劑3 mL,空白管加酶液0.5 mL,沸水浴放置10 min,冷卻后定容至25 mL,用空白管調(diào)零,540 nm測定OD值,以吸光度平均值查標(biāo)準(zhǔn)曲線計算 還原糖含量。
上述酶活測定,反應(yīng)后均用DNS法測定酶解 產(chǎn)生的還原糖量,酶活單位采用國際單位,lmL 酶液1 min分解底物生成1 nmol葡萄糖的酶量定 義為1個酶活單位,以IU/mL表示。
1.2.4形態(tài)鑒定
將菌株接種到PDA平板上,培養(yǎng)3天,觀察 菌落的特征。在平板上挑菌體少許,涂于載玻片上, 乳酸石碳酸棉蘭染色液染色后置于顯微鏡下觀察 (水浸片法),參照《真菌鑒定手冊》[9]進(jìn)行菌 種鑒定。
1.2.5 18SrDNA序列鑒定
100 mg菌絲樣品于液氮中研磨至粉末,保存 于1 mL離心管中[1°]。利用酵母總DNA提取試劑 盒(天根生化科技有限公司)提取菌株總DNA, 采用 ITS 1 (5'-TCCG TAGG TGAA CCTG CGG- 3,)和 ITS4 (5’-TCCT CGCC TTAT TGAT ATGC- 3')弓丨物擴(kuò)增菌株18SrDNA轉(zhuǎn)錄間隔區(qū)[11]。PCR 反應(yīng)體系為50 pL,程序為:94°C預(yù)變性5 min, 94。(:變性5〇8,51°(:退火5〇8,72°(:延伸2 111111, 30個循環(huán),最后72°C延伸10 min。擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)瓊 脂糖電泳檢測后送北京六合華大基因公司測序, 于NCBI數(shù)據(jù)庫Blast比對分析。
1.2.6產(chǎn)酶條件的優(yōu)化
首先進(jìn)行產(chǎn)酶培養(yǎng)基單@素試驗,保持培養(yǎng) 基中其他成分不變,分別改變其中的碳源、氮源、 初始pH和表面活性劑(鼠李糖脂)[12]這4個因素, 篩選出影響B(tài)-5菌株產(chǎn)纖維素酶的最佳單因素。 然后設(shè)計4因素3水平正交試驗[13],確定產(chǎn)纖維
120
陸晨,等:一株產(chǎn)纖維素酶真菌的篩選及產(chǎn)酶條件優(yōu)化
第6期
素酶的最優(yōu)組合。
2結(jié)果與分析
2.1初篩結(jié)果
利用CMC-Na培養(yǎng)基分離得到9株形態(tài)不同 菌種,有細(xì)菌、放線菌和真菌。剛果紅染色,均 產(chǎn)生大小不一水解圈,其中B-5菌株水解圈直徑 與菌落直徑比值并不是最大,見圖1。將分離得到 9株菌接種到濾紙液體培養(yǎng)基培養(yǎng)3d后,測定濾 紙失重率,其中接種B-5的培養(yǎng)基中濾紙條被崩 解成不規(guī)則小片,整個培養(yǎng)基成糊狀,見圖2,濾 紙失重率為最大,達(dá)37.9%»
表1各菌株酶活大小
Table 1 Cellulase activity of each strain IU/mL
菌株A-lA-2A-3A-4B-lB-2B-3B-4B-5
FPase1.330.890.561.140.610.731.061.152.09
CMCase3.841.560.782.450.591.062.141.185.20
2.3形態(tài)鑒定
PDA培養(yǎng)基28°C條件下培養(yǎng)4天后菌落直徑 達(dá)到3 cm左右,菌落起初呈粉白色,4°C保藏10 天后局部呈淡黃色,見圖3。菌落表面附著孢子, 絨毛狀。顯微鏡下觀察,菌絲纏繞抱團(tuán),由單細(xì) 胞鏈接而成,見圖4。通過菌落和菌絲特征,推測 其為一株真菌。
 
2.2復(fù)篩結(jié)果
對于以上9株菌均進(jìn)行了產(chǎn)酶實驗,它們的 FPA酶活和CMC酶活見表1,可見B-5的FPA酶 活和CMC酶活均最高。
獲得B-5菌總DNA模板后,利用ITS引物在 4個退火溫度梯度下(51X:、53T、551、57X:) 進(jìn)行PCR反應(yīng),均得到目的擴(kuò)增產(chǎn)物,大小700 bp左右,見圖5»測序拼接后登陸Genebank進(jìn)行 Blast比對,確定其為鐮刀菌屬,與木賊鐮刀菌同 源性達(dá)99%»
2.5 B-5鐮刀菌產(chǎn)酶條件的優(yōu)化
2.5.1不同碳源對產(chǎn)酶活力的影響
由圖6可見,利用CMC-Na為唯一碳源時, FPA酶活和CMC酶活均最高(2.09 IU/mL和5.20 IU/mL),但稻草秸稈是天然可再生資源,并且作 為農(nóng)業(yè)廢物利用率較低,在實際應(yīng)用方面具有優(yōu)
勢,故選取稻草作為唯一碳源進(jìn)行產(chǎn)酶條件優(yōu)化。 2.5.2稻草添加量對FPA酶活力的影響
由圖7可見,當(dāng)?shù)静萏砑恿吭?.5%?2.5% 之間時,隨著稻草添加量的增加,酶活不斷升高。 當(dāng)?shù)静萏砑恿繛?.5%時,F(xiàn)PA酶活最高為1.841 IU/mL.
2.5.3蛋白胨添加量對FPA酶活力的影響
由圖8可見,當(dāng)?shù)鞍纂颂砑恿吭?2%?0.8%之 間時,隨著蛋白胨添加量的增加,酶活不斷升高。當(dāng) 蛋白胨添加量為0.8%時,酶活最高為1.863 IU/mL。 2.5.4初始pH值對FPA酶活力的影響
保持培養(yǎng)基營養(yǎng)成分不變,當(dāng)培養(yǎng)基的初始 pH值在酸性環(huán)境下逐漸升高時,酶活也不斷升高。 當(dāng)初始pH值為6.1時FPA最高為1.875 IU/mL, 見圖9。
2.5.5表面活性劑對FPA酶活力的影響
保持培養(yǎng)基營養(yǎng)成分不變,分別添加〇%、 0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5% 的鼠李糖月旨(購 買的制劑,鼠李糖脂含量為50%?60%)。當(dāng)鼠 李糖脂添加量為0.1%時,F(xiàn)PA酶活最高為2.067 IU/mL,見圖 10。
圖6不同碳源對FPA_活力和CMC酶活力的影響 Fig.6 Effects of different carbon sources on FPase and CMCase
以.5.0.5 jl.1..0.
(--1)/胺謐
.0.5.0.5 2.1.L0.
(Ils.m)/ifi«
 
圖7不同稻萆添加量對FPA酶活力的影響 Fig.7 Effects of different rice straw content on FPase
〇.%.00.20.40.6- 0.81.01.21.4
蛋內(nèi)胨添加量
圖8不同蛋白胨添加量對FPA酶活力的影響 Fig.8 Effects of different amount of peptone on FPase
("?31)/餌避
-,15*01)/餌讞
°'3.03.54.04.55.05.56.06.57.0
初始pH值
圖9不同初始pH值對FPA酶活力的影響 Fig.9 Effects of different initial pH value on FPase
2.5.6產(chǎn)酶培養(yǎng)基優(yōu)化實驗
在以上單因素實驗的基礎(chǔ)上,選取培養(yǎng)基初 始pH、氮源(蛋白胨)、碳源(稻草)和表面活 性劑(鼠李糖脂)這四個因素作為B-5鐮刀菌產(chǎn)酶 過程中培養(yǎng)基優(yōu)化的因素,設(shè)計四因素三水平的 正交試驗如表2,試驗結(jié)果見表3。
表2正交試驗設(shè)計
Table 2 Orthogonal experimental design
水平因素
初始pH值氮源p/%碳源p/%表面活性劑P/%
14.80.620.1
25.50.82.50.2
36.11.03.00.3
表3正交試驗結(jié)果 Table 3 Orthogonal test results
因素初始pH值氮源
p/%碳源
p/%表面活性劑
p/%酶活
/(IU-mL-1)
111111,257
212221.859
313331.791
421231.675
522312.042
623121.605
731321.562
832131.831
933212.205
4.9074.4944.6935.504
K25.3225/7325.7395.026
5.5985.6015.3955.297
R0.6911.2381.0460.478
各因素對FPA酶活影響的大小順序為氮源> 碳源 > 初始pH值> 表面活性劑。從試驗結(jié)果中得 出最優(yōu)組合:初始pH為6.1,氮源濃度為1.0%, 碳源濃度為2.5%,鼠李糖脂添加量為0.1%,酶活 最高為 2.205 IU/mL。
° 0.00.10.20.30.40.50.6
鼠李糖脂添加量
圖10不同鼠李糖脂添加量對FPA酶活力的影響 Fig.10 Effects of different rhamnolipid content on FPase
3結(jié)論
本研究從原始的自然環(huán)境采集樣品,利用剛 果紅染色和濾紙崩解等基礎(chǔ)方法分離篩選出產(chǎn)纖 維素酶的菌種9株。鑒于細(xì)菌、放線菌和真菌的 生長形式不同,剛果紅染色產(chǎn)生水解圈的大小并 不能作為其產(chǎn)纖維素酶活力高低的唯一標(biāo)準(zhǔn),于 是利用濾紙的崩解效率進(jìn)行反復(fù)驗證。最后精確 測定FPA酶活和CMC酶活確定產(chǎn)酶最優(yōu)的菌種 B-5。菌種鑒定時,首先通過觀察菌落形態(tài)和菌 絲結(jié)構(gòu)基本確定其為一株真菌,然后利用酵母總 DNA提取試劑盒提取其總DNA作為模板,通過 ITS1和ITS4引物擴(kuò)增其18SrDNA轉(zhuǎn)錄間隔區(qū), 在NCBI數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行Blast比對確定其為一株鐮 刀菌。在產(chǎn)酶優(yōu)化實驗中,將FPA酶活力(全酶活) 大小作為唯一標(biāo)準(zhǔn),確定最優(yōu)產(chǎn)酶培養(yǎng)基:稻草 粉末 25g/L,蛋白胨 10g/L, KH2P042g/L, CaCl2 •2H20 0.4 g/L, MgS04-7H20 0.02 g/L, Mandels 微量元素濃縮液1 mL/L, 1 mol檸檬酸緩沖液50 mL/L,鼠李糖脂添加量0.1%, pH為6.1。FPA酶活 為 2.205 IU/mL,相應(yīng) CMC 酶活為 5.174 IU/mL»
鐮刀菌通常作為植物甚至農(nóng)作物的致病菌進(jìn) 行研究[14],在原始森林中篩選出的B-5鐮刀菌具 有較高產(chǎn)纖維素酶能力,利用稻草作為碳源時有 良好的產(chǎn)纖維素酶效果。雖然酶活離預(yù)期還有一 段距離[15],但是通過其它的條件優(yōu)化仍有提高潛 力,本研究不僅拓寬了產(chǎn)纖維素酶的菌譜,也為 尋求稻草秸稈新的利用途徑做出了貢獻(xiàn)。